Cadre et objectifs du stage :

Problème émergeant de santé publique, l’hépatite E (HEV) est également un problème lié à la santé animale et environnementale et donc un modèle de pathogène pertinent pour des approches de type « One Health ». En Corse, le virus est particulièrement endémique chez les humains (très majoritairement asymptomatique), mais surtout chez les suidés sauvages et domestiques. En effet, les systèmes d’élevage porcins semi-extensifs, valorisant les ressources spontanées, exposent les porcs aux contacts directs et indirects avec les sangliers, dont la population est élevée. Il en résulte une diffusion importante du virus entre ces deux compartiments. Mais les pratiques d’élevage, la densité des populations de suidés varient d’une vallée à l’autre, du fait de la haute diversité des contextes pédo-climatiques en Corse. Les patrons épidémiologiques du HEV, mais également les souches du virus, sont donc potentiellement très variés dans leurs formes et leurs spatialités. L’objectif du stage est de mettre en évidence des réseaux spécifiques de diffusion du HEV entre suidés sauvages et domestiques, via la caractérisation de profils de zones (petit groupe de communes) contrastées en termes de pratiques d’élevage, de densité d’animaux, de contextes pédo-climatiques, etc.

Le stage est réalisé dans le cadre du projet VHEEP (virus de l’hépatite E : dynamique d’Exposition et de Partage dans les milieux et les filières), financé par le métaprogramme SYALSA (Systèmes alimentaires et santé humaine) d’INRAE. Ce projet implique les unités BIOSCOPE (UCPP-INSERM), ASTRE (Cirad-INRAE), SELMET (Cirad-INRAE-SupAgro) et SELMET-LRDE (INRAE).

Période de stage :

du 4 avril au 7 juillet  2022

Localisation de l’étude s’il y a lieu :

Corse

Unité(s) d’accueil :

INRAE-SELMET-LRDE, Corte

Encadrement :

François Charrier – UR SELMET-LRDE

Ferran Jori - CIRAD